Единният център за иновации е координационно звено за провеждане политиката на БАН – в сферата на иновациите, патентната дейност и проектната компетентност. Центърът предоставя информация за кандидатстване по Европейските структурни фондове и Рамковата програма на ЕС „Хоризонт 2020“ и подпомага подготовката и изпълнението на проектни предложения. Центърът осъществява делови контакти в страната и чужбина в областта на иновациите и трансфера на приложни научни изследвания, подпомага създаването на делови контакти „наука – бизнес“ и „наука – наука“.

ЕЦИ партнира с институтите и лабораториите на БАН, с университети и със сходни на ЕЦИ европейски формирования, с Българска търговско-промишлена палата, Българска стопанска камара и с регионалните им клонове, както и с неправителствени организации със сходни цели. Центърът е партньор в Enterprise Europe Network – най-голямата информационно-консултантска мрежа в Европа и света, подпомагаща бизнеса и науката в развитието на техния иновационен потенциал. Една от основните дейности на ЕЦИ в Enterprise Europe Network е намирането и промотирането на изследователски и технологични разработки и тяхното предлагане в световна електронна борса, както и подкрепа за създаването на партньорства. ЕЦИ е съосновател на Офис за технологичен трансфер ПРОИНО. Създаден е през 2005 г. като ЦИ и е преструктуриран през 2010 г. в ЕЦИ.